Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLF2Q8IX21 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms