Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTF1AQ7RTS3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms