Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP50Q70EL3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP50Q70EL3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms