Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP31Q70CQ4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms