Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms