Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms