Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms