Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms