Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCTP1Q6DN14 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms