Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG9BQ674R7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms