Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C9orf84Q5VXU9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C9orf84Q5VXU9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms