Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRNL1Q5VV63 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRNL1Q5VV63 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms