Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF220Q5VTB9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF220Q5VTB9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms