Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAPCD1Q5SSQ6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAPCD1Q5SSQ6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms