Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGD3Q5JSP0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms