Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM47AQ5JRC9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM47AQ5JRC9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms