Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC178Q5BJE1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms