Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFT2D3Q587I9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms