Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC93Q567U6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms