Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC23Q53EV4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms