Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP100Q494V2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP100Q494V2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms