Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HFEQ30201 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HFEQ30201 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HFEQ30201 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms