Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms