Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT24Q2M2I5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT24Q2M2I5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms