Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKIDA1Q1XH10 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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