Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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RTN1Q16799 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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RTN1Q16799 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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RTN1Q16799 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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RTN1Q16799 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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RTN1Q16799 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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