Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ECM1Q16610 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ECM1Q16610 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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