Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SSX1Q16384 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SSX1Q16384 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SSX1Q16384 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SSX1Q16384 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SSX1Q16384 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSX1Q16384 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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