Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC85BQ15834 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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