Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCOA1Q15788 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
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NCOA1Q15788 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
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NCOA1Q15788 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
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NCOA1Q15788 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
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NCOA1Q15788 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
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NCOA1Q15788 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
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NCOA1Q15788 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
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NCOA1Q15788 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCOA1Q15788 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
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