Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF1CQ15572 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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