Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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UBE3CQ15386 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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