Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPAQ15257 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPAQ15257 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
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