Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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