Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCAPD2Q15021 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NCAPD2Q15021 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms