Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPNMBQ14956 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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GPNMBQ14956 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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GPNMBQ14956 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPNMBQ14956 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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