Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
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CHD4Q14839 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHD4Q14839 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
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