Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMC1AQ14683 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMC1AQ14683 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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