Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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GBX1Q14549 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBX1Q14549 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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