Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASGRF1Q13972 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms