Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDX39BQ13838 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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