Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOFQ13790 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOFQ13790 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOFQ13790 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOFQ13790 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOFQ13790 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOFQ13790 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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