Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HTR4Q13639 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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