Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PKD2Q13563 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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PKD2Q13563 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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PKD2Q13563 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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PKD2Q13563 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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PKD2Q13563 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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PKD2Q13563 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKD2Q13563 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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