Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATRQ13535 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATRQ13535 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATRQ13535 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATRQ13535 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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