Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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FOXE3Q13461 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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FOXE3Q13461 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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FOXE3Q13461 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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FOXE3Q13461 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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FOXE3Q13461 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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FOXE3Q13461 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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FOXE3Q13461 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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FOXE3Q13461 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXE3Q13461 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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FOXE3Q13461 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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FOXE3Q13461 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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