Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF1Q13351 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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