Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3FQ13275 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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