Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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CALCOCO2Q13137 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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CALCOCO2Q13137 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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