Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN3Q13064 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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